Tumörnekrosfaktor superfamilj - Tumor necrosis factor superfamily

Tumörnekrosfaktor superfamilj
Mus tumörnekrosfaktor Alpha.png
Trimerisk struktur av TNF-alfa, producerad av Mus musculus , baserad på PDB-struktur 2TNF (1,4 Å upplösning). Olika färger representerar olika monomerer. Baeyens, KJ et al. (1999). Figur gjord med FirstGlance Jmol.
Identifierare
Symbol TNF
Pfam PF00229
InterPro IPR006052
PROSITE PDOC00224
SCOP2 1tnf / SCOPe / SUPFAM
OPM-superfamilj 292
OPM-protein 2hew
Membranom 80
TNF
FBB 1du3 EBI.jpg
kristallstruktur av trail-sdr5
Identifierare
Symbol TNF
Pfam PF00229
Pfam- klan CL0100
InterPro IPR006052
PROSITE PDOC00561
SCOP2 1tnr / SCOPe / SUPFAM

Den tumörnekrosfaktor ( TNF ) superfamiljen är en proteinsuper av typ II transmembranproteiner som innehåller TNF-homologidomän och formnings trimerer . Medlemmar i denna superfamilj kan frigöras från cellmembranet genom extracellulär proteolytisk klyvning och fungera som ett cytokin . Dessa proteiner uttrycks huvudsakligen av immunceller och de reglerar olika cellfunktioner, inklusive immunsvar och inflammation, men också proliferation, differentiering, apoptos och embryogenes.

Superfamiljen innehåller 19 medlemmar som binder till 29 medlemmar av TNF-receptorsfamiljen . En förekomst av ortologer hos ryggradslösa djur antyder det forntida ursprunget till denna superfamilj i evolutionen.

Den PROSITE mönstret av denna superfamilj är beläget i ett betaflak i den centrala delen av det protein som är konserverad över alla medlemmar.

Medlemmar

Det finns 19 familjemedlemmar, numeriskt klassificerade som TNFSF #, där # betecknar medlemsnumret, ibland följt av en bokstav.

TNFSF # namn Synonymer Gen Fungera
1 Lymphotoxin alfa TNFp, TNFSF1B LTA Induktion av inflammation och antiviralt svar, utveckling av sekundära lymfoida organ , roll i tumörgenes
2 Tumörnekrosfaktor TNFα, Dif, Nekrosin, TNFSF1A, ... TNF Reglering av immunceller, induktion av feber , kakexi , inflammation och apoptos , hämning av tumörgenes och viral replikering och svar på sepsis
3 Lymphotoxin beta TNFy LTB Induktion av inflammation och antiviralt svar, utveckling av sekundära lymfoida organ , roll i tumörgenes
4 OX40-ligand CD252, Gp34, CD134L TNFSF4 Aktivering av T-cells immunsvar genom T- cellskostimulering
5 CD40-ligand CD154, TRAP, Gp39, T-BAM CD40LG Reglering av adaptivt immunsvar genom att aktivera antigenpresenterande cell
6 Fas ligand CD178, APTL, CD95L FASLG Reglering av T-cell homeostas genom induktion av apoptos
7 CD27-ligand CD70 CD70 Reglering av B- cellaktivering och T-cell homeostas
8 CD30-ligand CD153 TNFSF8 Induktion av apoptos av T-celler och B-celler , förebyggande av autoimmunitet
9 CD137-ligand 4-1 BBL TNFSF9
10 TNF-relaterad apoptosinducerande ligand CD253, APO-2L TNFSF10 Hämning av tumörgenes , induktion av apoptos
11 Receptoraktivator för kärnfaktor kappa-Β ligand CD254, OPGL, TRANCE, ODF TNFSF11 Vävnadstillväxt (särskilt benregenerering och ombyggnad), dendritisk cellmognad
12 TNF-relaterad svag inducerare av apoptos APO-3L, DR3L TNFSF12 Reglering av angiogenes , induktion av apoptos
13 En proliferationsinducerande ligand CD256, TALL-2, TRDL1 TNFSF13 Reglering av B-cellsutveckling och plasma cellöverlevnad
13B B-cellaktiverande faktor CD257, BLyS, TALL-1, TNFSF20, ... TNFSF13B Stimulering av B- cellproliferation och differentiering
14 LJUS CD258, HVEML TNFSF14 Stimulering av T-cellproliferation, apoptos reglering
15 Vaskulär endotelväxtinhibitor TL1, TL-1A TNFSF15 Hämning av angiogenes
18 TNF-superfamiljmedlem 18 GITRL, AITRL, TL-6 TNFSF18 Reglering av T- cellöverlevnad
19 Ektodysplasin A ED1-A1, ED1-A2 EDA Utveckling av ektodermala vävnader

Referenser

Denna artikel innehåller text från det offentliga området Pfam och InterPro : IPR006052

externa länkar