SHC014 -CoV - SHC014-CoV
SHC014-CoV | |
---|---|
Virusklassificering | |
(orankad): | Virus |
Rike : | Riboviria |
Rike: | Orthornavirae |
Provins: | Pisuviricota |
Klass: | Pisoniviricetes |
Beställa: | Nidovirales |
Familj: | Coronaviridae |
Släkte: | Betacoronavirus |
Subgenus: | Sarbecovirus |
Arter: | |
Anstränga: |
SHC014-CoV
|
Synonymer | |
|
SHC014-CoV är ett SARS- liknande coronavirus (SL-COV) som infekterar hästskofladdermöss (familj Rhinolophidae). Det upptäcktes i Kunming County i Yunnan -provinsen , Kina. Det upptäcktes tillsammans med SL-CoV Rs3367, som var det första fladdermus SARS-liknande coronaviruset som visade sig direkt infektera en mänsklig cellinje. Raden på Rs3367 som infekterade mänskliga celler fick namnet Bat SARS-liknande coronavirus WIV1 .
Upptäckt
Från april 2011 till september 2012 samlade forskare från Wuhan Institute of Virology 117 analpinnar och avföringsprover av fladdermöss från en kinesisk rufous hästskofladdermus ( Rhinolophus sinicus ) i Kunming City (Yunnan-provinsen i sydvästra Kina). 27 av 117 prover (23%) innehöll sju olika isolat av SARS-liknande coronavirus, varav två tidigare okända, kallade RsSHC014 och Rs3367.
Virologi
År 2013 visade fladdermus SARS-liknande coronavirus Rs3367 sig kunna infektera den mänskliga HeLa-cellinjen direkt . Det var första gången som mänskliga celler hade smittats med en fladdermus SARS-liknande coronavirus i labbet. Stammen på Rs3367 som infekterade de mänskliga cellerna fick namnet "Bat SARS-liknande coronavirus WIV".
År 2015 genomförde University of North Carolina vid Chapel Hill och Wuhan Institute of Virology forskning som visade att SHC014 kan göras för att infektera den mänskliga HeLa -cellinjen genom att använda omvänd genetik för att skapa ett chimärt virus bestående av ett ytprotein av SHC014 och ryggraden i ett SARS-corona-virus.
SL-SHC014-MA15-versionen av viruset, främst konstruerad för att infektera möss, har visat sig skilja sig med över 5000 nukleotider från SARS-CoV-2 , orsaken till COVID-19-pandemin .
Filogenetisk
Ett fylogenetiskt träd baserat på helgenomsekvenser av SARS-CoV-1 och relaterade coronavirus är:
SARS -CoV -1 -relaterat coronavirus |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SARS-CoV-2 , 79% till SARS-CoV-1 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Se även
Referenser
Referenser
- Data relaterade till SHC014-CoV på Wikispecies