Richard M. Durbin - Richard M. Durbin

Richard Durbin
Richard Durbin på sitt kontor på WTSI
Född	Richard Michael Durbin ( 1960-12-30 )30 december 1960 (60 år)
Nationalitet	Brittiska
Alma mater	University Cambridge (BA, PhD)
Känd för
Makar)	Julie Ahringer ​ ( m.  1996)​
Utmärkelser
Vetenskaplig karriär
Fält
Institutioner
Avhandling	Studier om utveckling och organisering av nervsystemet hos Caenorhabditis elegans  (1987)
Doktorandrådgivare	John G. White
Doktorander	Ewan Birney
Andra anmärkningsvärda studenter
Hemsida	sanger .ac .uk / personer / katalog / durbin-richard

Richard Michael Durbin , FRS , född den 30 december 1960 (60 år) , är en brittisk beräkningsbiolog . Han är för närvarande biträdande fakultetsmedlem vid Wellcome Trust Sanger Institute och professor i genetik vid University of Cambridge . Tidigare var han seniorgruppsledare vid Wellcome Trust Sanger Institute i över 20 år och hedersprofessor i beräkningsgenomik vid University of Cambridge . ( 1960-12-30 )

Utbildning

Durbin utbildades vid The Hall School Hampstead och Highgate School i London. Efter att ha tävlat i den internationella matematiska olympiaden 1978/9 fortsatte han att studera vid University of Cambridge och tog examen 1982 med en avancerad examen i Cambridge Mathematical Tripos . Efter examen fortsatte han att studera för doktorsexamen vid St John's College, Cambridge och studera utvecklingen och organisationen av nervsystemet i Caenorhabditis elegans medan han arbetade vid Laboratory of Molecular Biology (LMB) i Cambridge, övervakad av John Graham White .

Forskning

Durbins tidiga arbete innefattade utveckling av det primära instrumentprogramvaran för en av de första röntgenkristallografiska områdesdetektorerna och MRC Biorad konfokalmikroskop, tillsammans med bidrag till neural modellering.

Han ledde sedan informatiken för genomprojektet Caenorhabditis elegans , och tillsammans med Jean Thierry-Mieg utvecklade genomdatabasen AceDB , som utvecklades till WormBase- webbresursen. Efter detta spelade han en viktig roll i datainsamlingen för och tolkningen av den mänskliga genomsekvensen.

Han har utvecklat ett antal metoder för beräkningssekvensanalys . Dessa inkluderar genfynd (t.ex. GeneWise) med Ewan Birney och Hidden Markov-modeller för protein- och nukleinsyrajustering och matchning (t.ex. HMMER ) med Sean Eddy och Graeme Mitchison. En standardlärobok Biologisk sekvensanalys tillsammans med Sean Eddy , Anders Krogh och Graeme Mitchison beskriver en del av detta arbete. Med hjälp av dessa metoder arbetade Durbin med kollegor för att bygga en serie viktiga genomiska dataresurser, inklusive proteinfamiljdatabasen Pfam , genomdatabasen Ensembl och genfamiljdatabasen TreeFam .

På senare tid har Durbin återgått till sekvensering och har utvecklat metoder för att täcka populationsgenomsekvenser med låg täckning, applicerat först på jäst och har varit en av ledarna inom tillämpningen av ny sekvenseringsteknik för att studera mänsklig genomvariation. Durbin leder för närvarande det internationella 1000 genomprojektet för att karakterisera variation ner till 1% allelfrekvens som en grund för human genetik.

Utmärkelser och utmärkelser

Durbin var en gemensam vinnare av Mullard Award av Royal Society 1994 (för arbete med konfokalmikroskopet ), vann Lord Lloyd of Kilgerran Award av Foundation for Science and Technology 2004 och valdes till stipendiat för Royal Society (FRS) 2004 och medlem i European Molecular Biology Organization (EMBO) 2009. Royal Society delade ut sin Gabor-medalj till Durbin 2017 för sina bidrag till beräkningsbiologi.

Durbins intyg om val till Royal Society lyder:

Durbin utmärker sig för sitt kraftfulla bidrag till beräkningsbiologi. I synnerhet spelade han en ledande roll för att etablera det nya området bioinformatik. Detta gör det möjligt att hantera biologiska data i en aldrig tidigare skådad skala, vilket gör det möjligt för genomik att blomstra. Han ledde analysen av C. elegans- genomet och utvecklade tillsammans med Thierry-Mieg databasprogramvaran AceDB . I det internationella genomprojektet ledde han analysen av proteinkodande gener. Han introducerade viktiga beräkningsverktyg inom programvara och datahantering. Hans Pfam- databas tillät identifiering av domäner i nya proteinsekvenser ; den använde dolda Markov-modeller till vilken strategi han generellt tog med rigor och som ledde till kovariansmodeller för RNA- sekvens.

Privatliv

Durbin är son till James Durbin och är gift med Julie Ahringer , en forskare vid Gurdon Institute . De har två barn, Benjamin och Zoe.

Referenser

externa länkar

• Richard M. Durbin- publikationer indexerade av Google Scholar