McDonnell Genome Institute - McDonnell Genome Institute
| Etablerade | 1993 |
|---|---|
Forskningsområde |
|
| Direktör | Jeffrey Milbrandt |
| Plats | St. Louis, Missouri |
| Affiliations | |
| Hemsida | genom.wustl.edu |
McDonnell Genome Institute ( Elizabeth H. och James S. McDonnell III Genome Institute ) vid Washington University i St. Louis , Missouri , är en av tre NIH- finansierade storskaliga sekvenseringscentra i USA . Ansluten till Washington University School of Medicine och Alvin J. Siteman Cancer Center , McDonnell Genome Institute skapar, testar och implementerar nya tillvägagångssätt för studier av genomik med målet att förstå människors hälsa och sjukdomar, samt evolution och biologi. av andra organismer.
Historia
McDonnell Genome Institute, tidigare Genome Sequencing Center och The Genome Institute, grundades 1993 och började som en nyckelaktör i Human Genome Project , vilket slutligen bidrog med mer än 25 procent av den färdiga sekvensen. Efter fullbordandet av arbetsutkastet för det mänskliga genomet 2000 och den färdiga mänskliga genomsekvensen 2003 vände McDonnell Genome Institute sin sekvenserings- och analysförmåga för att bestämma genomerna hos många andra organismer för att ge de första referenssekvenserna för dessa arter. . År 2014 utlovade medborgarledare och långvariga filantroper Elizabeth H. och James S. McDonnell III 25 miljoner dollar till The Genome Institute, som döptes om till Elizabeth H. och James S. McDonnell III Genome Institute vid Washington University.
Projekt
- Cancergenomen Atlas jämför DNA-sekvenser hos vuxna cancerpatienter och deras tumörer för att identifiera de genetiska förändringar som är viktiga för cancer.
- Human Microbiome Project sekvenserar genomet hos mikrober som är involverade i människors hälsa och sjukdomar.
- 1000 Genomes Project försöker katalogisera den enorma mänskliga variationen som skrivs in i den genetiska koden.
- Washington University Cancer Genome Initiative föreskriver att hundratals tumör- och normalprovgenom ska sekvenseras.
- Pediatrisk cancergenoprojekt är ett samarbete med St. Jude Children's Research Hospital för att identifiera de genetiska förändringar som ger upphov till några av världens dödligaste cancer i barndomen.
- Medical Sequencing riktar sig mot sekvenser från sjukdomar som metaboliska syndrom och synrelaterade störningar för att hjälpa till att individualisera patientbehandling.
Personal
McDonnell Genome Institute har över 300 heltidsanställda lärare och personal från olika discipliner. Kärnpersonal inkluderar:
Jeffrey Milbrandt , MD, doktor: Dr. Milbrandt är verkställande direktör för McDonnell Genome Institute.
Aktiviteter
Helgenomsekvensering: Helgenomsekvenseringsgruppen fokuserar på att utveckla och optimera provintag, produktionssekvensering och sekvensanalysrör för mänsklig sjukdom genomisk forskning, med stor tonvikt på cancer.
De Novo Assembly: De Novo Assembly Group är ansvarig för att ta sekvenserade bitar av olika arts genom och sätta ihop dem så sammanhängande och exakt som möjligt.
Mikrobiell genomik: Microbial Genomics Group representerar en rad aktiviteter från sekvensering av enskilda bakterier till populationsgenomstudier av mikrobiella arter till analys av komplexa metagenomiska prover.
Targeted Re-sequencing: The Targeted Re-sequencing Group sekvenserar specifika genomregioner med flera olika metoder inklusive PCR såväl som hybridvalstekniker.
Transcriptomes: Transcriptomes Group arbetar med de olika aspekterna av sekvensering och analys av transcriptomes, baserat på nästa generations sekvensering av RNA.
Data
McDonnell Genome Institute gör all sekvensinformation tillgänglig för forskarsamhället i väntan på lämplig kvalitetsanalys. En del av dessa uppgifter är preliminära och är föremål för utelämnanden och fel. Data ändras också baserat på tillgängligheten av nya data och monteringsversioner.
Enligt NHGRI : s policy för datautsläpp måste alla användare erkänna McDonnell Genome Institute som datakälla.
Uppsökande
McDonnell Genome Institute's Outreach Department grundades 2003 som svar på National Human Genome Research Institute : s minoritetshandlingsplan. Sedan starten har Outreach genomfört aktiviteter som tjänar till att utbilda K-12-studenter och samhället i stort beträffande genomik och den roll som McDonnell Genome Institute spelar inom detta område. Outreach har varit värd för tusentals kunder genom rundturer, presentationer, vetenskapsmässor och olika besök på plats. Avdelningen etablerade möjligheter inom genomforskning vars syfte är att öka antalet underrepresenterade minoriteter som får doktorsexamen inom genomik / genetik. Två program har genomförts under OGR, som ger forskningsmöjligheter för studenter (grundutbildade forskare) och nyutbildade akademiker (omfattande studie).
Faciliteter
McDonnell Genome Institute ligger på Washington University School of Medicine i St. Louis, Missouri, på 4444 Forest Park Avenue. Det är tillgängligt med Metrolink (Central West End Station).
McDonnell Genome Institute har ett separat datacenter som ligger tvärs över gatan vid Newstead Avenue 222. Datacentret på 20 miljoner USD, 16 000 kvadratmeter, byggdes med helt redundanta kraft- och kylsystem som kan rymma över 100 rack med beräknings- och lagringssystem med hög densitet.
McDonnell Genome Instituts datacenter är den första "gröna" byggnaden på School of Medicine's campus och har fått ledarskapet i Energy and Environmental Design (LEED) Gold-status av US Green Building Council . Datacentret rymmer också ett äldre serverrum på 1200 kvadratmeter (110 m 2 ) utrustat med upphöjda golv, överflödig kraft och kylning.
Referenser
externa länkar
Koordinater : 38 ° 38′13,7 ″ N 90 ° 15′24,8 ″ V / 38,637139 ° N 90,256889 ° W