Farnesoid X -receptor - Farnesoid X receptor

NR1H4
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisökning: PDBe RCSB
Lista över PDB -ID -koder
	1OSH , 3BEJ , 3DCT , 3DCU , 3FLI , 3FXV , 3GD2 , 3HC5 , 3HC6 , 3L1B , 3OKH , 3OKI , 3OLF , 3OMK , 3OMM , 3OOF , 3OOK , 3RUT , 3RUU , 3RVF , 3P88 , 3P89 , 4OIV , 4WVD , 4QE6 , 4QE8
Identifierare
Alias	NR1H4 , BAR, FXR, HRR-1, HRR1, RIP14, kärnreceptorsundfamilj 1 grupp H medlem 4, PFIC5
Externa ID: n	OMIM : 603826 MGI : 1352464 HomoloGene : 3760 GenKort : NR1H4
Genläge ( mänskligt )
Chr.	Kromosom 12 (människa)
Slutet	100 564 414 bp
Genläge ( mus )
Chr.	Kromosom 10 (mus)
Slutet	89 533 585 bp
RNA -uttrycksmönster
	Mer referensuttrycksdata
Genontologi
Molekylär funktion	• GO: 0000980 RNA-polymeras II cis-regulatorisk regionsekvensspecifik DNA-bindning ; • sekvensspecifik DNA-bindning ; • DNA-bindning ; • GO: 0001106 transkriptionskorepressoraktivitet ; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNA- bindande transkriptionsfaktoraktivitet ; • GO: 0001105 transkriptionskoaktivatoraktivitet ; • zinkjonbindning ; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 DNA-bindande transkriptionsaktivatoraktivitet, RNA-polymeras II-specifik ; • metalljon bindning ; • retinoid X-receptorbindning ; • steroidhormonreceptoraktivitet ; • gallsyrabindning ; • GO: 0001948 proteinbindning ; • nukleär receptorbindning ; • transkriptionsfaktoraktivitet, RNA-polymeras II distal förstärkarsekvensspecifik bindning ; • kinodeoxikolsyrabindning ; • GO: 0000975 transkription cis- regulatorisk regionbindning ; • RNA-polymeras II-transkription regulatorisk regionsekvensspecifik DNA-bindning ; • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 kärnreceptoraktivitet ; • gallsyrareceptoraktivitet ; • GO: 0001200 , GO: 0001133, GO: 0001201 DNA-bindande transkriptionsfaktoraktivitet, RNA-polymeras II-specifik ; • transkriptionsfaktorbindning ; • kärnreceptorkoaktivatoraktivitet ; • signalreceptoraktivitet;
Cellulär komponent	• nukleoplasma ; • kärna ; • RNA -polymeras II -transkriptionsregulatorkomplex;
Biologisk process	• Notch signalväg ; • cellulär triglycerid homeostas ; • cellulärt svar på organisk kväveförening ; • reglering av insulinsekretion som är involverad i cellulärt svar på glukosstimulering ; • positiv reglering av ammoniakassimileringscykel ; • tolvliknande receptor 4 signalväg ; • immunsystemsprocess ; • histon H3-R17 metylering ; • reglering av transkription med RNA-polymeras II ; • positiv reglering av metabolismen av glutamat ; • signalväg för intracellulär gallsyrareceptor ; • negativ reglering av apoptotisk process ; • negativ reglering av transkription med RNA-polymeras II ; • transkription, DNA-mallad ; • reglering av lågdensitet lipoproteinpartikel clearance ; • reglering av gallsyra biosyntetisk process ; • reglering av kolesterolmetabolisk process ; • reglering av urea metabolisk process ; • intracellulär receptorsignaleringsväg ; • negativ reglering av gallsyra biosyntetisk process ; • cellulärt svar på fettsyra ; • gallsyra och gallsalttransport ; • kväve katabolitaktivering av transkription från RNA -polymeras II -promotor ; • transkriptionsinitiering från RNA -polymeras II -promotor ; • inflammatoriskt svar ; • medfött immunsvar ; • signaltransduktion ; • steroidhormonförmedlad signalväg ; • fettsyrahomeostas ; • positiv reglering av insulinreceptorsignalväg ; • cellulärt svar på lipopolysackarid ; • negativ reglering av interleukin-2-produktion ; • positiv reglering av insulinsekretion som är involverad i cellulärt svar på glukosstimulering ; • negativ reglering av inflammatoriskt svar ; • glukoshomeostas ; • negativ reglering av NF-kappaB-transkriptionsfaktoraktivitet ; • positiv reglering av fettvävnadsutveckling ; • cell- cellkorsningsenhet ; • tolvliknande receptor 9-signalväg ; • negativ reglering av monocytkemotaktisk protein-1-produktion ; • gallsyrametabolisk process ; • negativ reglering av I-kappaB-kinas/NF-kappaB-signalering ; • negativ reglering av tumörnekrosfaktormedierad signal pa thway ; • försvarssvar på bakterier ; • negativ reglering av interleukin-1-produktion ; • negativ reglering av tumörnekrosfaktorproduktion ; • negativ reglering av interleukin-6-produktion ; • triglyceridhomeostas ; • negativ reglering av interferon-gamma-produktion ; • reglering av transkription, DNA-mallad ; • gallsyrasignaleringsväg ; • positiv reglering av transkription med RNA -polymeras II ; • positiv reglering av fosfatidsyra biosyntetisk process ; • kolesterolhomeostas ; • lipidmetabolism ; • flercellig organismutveckling ; • celldifferentiering ; • lipidhemostas ; • cellulär glukoshomeostas;
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	9971
	20186
	ENSG00000012504
	ENSMUSG00000047638
	Q96RI1
	Q60641
NM_001206977 ; NM_001206978 ; NM_001206979 ; NM_001206992 ; NM_001206993;
	NM_005123
	NM_001163504 ; NM_001163700 ; NM_009108
NP_001193906 ; NP_001193907 ; NP_001193908 ; NP_001193921 ; NP_001193922;
	NP_005114 ; NP_001193906.1 ; NP_001193908.1
	NP_001156976 ; NP_001157172 ; NP_033134 ; NP_001372640
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Den gallsyra-receptorn ( BAR ), även känd som farnesoid X-receptorn ( FXR ) eller NR1H4 (nukleär receptor subfamiljen 1, gruppen H, elementet 4), är en nukleär receptor som kodas av NR1H4 genen hos människor.

Fungera

FXR uttrycks vid höga nivåer i levern och tarmen. Chenodeoxykolsyra och andra gallsyror är naturliga ligander för FXR. Liksom andra kärnreceptorer, vid aktivering, translokerar FXR till cellkärnan , bildar en dimer (i detta fall en heterodimer med RXR ) och binder till hormonresponselement på DNA, vilket upp- eller nedreglerar uttrycket av vissa gener .

En av de primära funktionerna för FXR-aktivering är undertryckandet av kolesterol 7 alfa-hydroxylas (CYP7A1), det hastighetsbegränsande enzymet vid gallsyrasyntes från kolesterol . FXR binder inte direkt till CYP7A1 -promotorn. Snarare inducerar FXR uttryck av liten heterodimer partner (SHP), som sedan fungerar för att hämma transkription av CYP7A1 -genen. På detta sätt etableras en negativ återkopplingsväg där syntes av gallsyror hämmas när cellulära nivåer redan är höga.

FXR har också visat sig vara viktigt för reglering av triglyceridnivåer i levern . Specifikt, FXR aktivering trycker lipogenes och främjar fri fettsyra oxidation av PPARa -aktivering. Studier har också visat FXR för att reglera uttrycket och aktiviteten hos epiteltransportproteiner som är involverade i vätskehomeostas i tarmen, såsom cystisk fibros transmembran konduktansregulator (CFTR).

Aktivering av FXR hos diabetiska möss minskar plasmaglukos och förbättrar insulinkänsligheten , medan inaktivering av FXR har motsatt effekt.

Interaktioner

Farnesoid X -receptor har visat sig interagera med:

Ligander

Ett antal ligander för FXR är kända, av både naturligt och syntetiskt ursprung.

Agonister

Antagonister

Guggulsterone

Referenser

Vidare läsning

Kalaany NY, Mangelsdorf DJ (2006). "LXRS och FXR: yin och yang för kolesterol och fettmetabolism". Årlig granskning av fysiologi . 68 : 159–91. doi : 10.1146/annurev.physiol.68.033104.152158 . PMID 16460270 .
Kuipers F, Stroeve JH, Caron S, Staels B (juni 2007). "Gallsyror, farnesoid X -receptor, åderförkalkning och metabolisk kontroll". Nuvarande åsikt i lipidologi . 18 (3): 289–97. doi : 10.1097/MOL.0b013e3281338d08 . PMID 17495603 . S2CID 7385142 .
Seol W, Choi HS, Moore DD (jan 1995). "Isolering av proteiner som interagerar specifikt med retinoid X -receptorn: två nya föräldralösa receptorer" . Molekylär endokrinologi . 9 (1): 72–85. doi : 10.1210/reparera.9.1.7760852 . PMID 7760852 .
Zavacki AM, Lehmann JM, Seol W, Willson TM, Kliewer SA, Moore DD (juli 1997). "Aktivering av den föräldralösa receptorn RIP14 av retinoider" . Förfaranden vid National Academy of Sciences i USA . 94 (15): 7909–14. Bibcode : 1997PNAS ... 94.7909Z . doi : 10.1073/pnas.94.15.7909 . PMC 21528 . PMID 9223286 .
Makishima M, Okamoto AY, Repa JJ, Tu H, Learned RM, Luk A, Hull MV, Lustig KD, Mangelsdorf DJ, Shan B (maj 1999). "Identifiering av en kärnreceptor för gallsyror". Vetenskap . 284 (5418): 1362–5. Bibcode : 1999Sci ... 284.1362M . doi : 10.1126/science.284.5418.1362 . PMID 10334992 .
Parks DJ, Blanchard SG, Bledsoe RK, Chandra G, Consler TG, Kliewer SA, Stimmel JB, Willson TM, Zavacki AM, Moore DD, Lehmann JM (maj 1999). "Gallsyror: naturliga ligander för en föräldralös kärnreceptor". Vetenskap . 284 (5418): 1365–8. Bibcode : 1999Sci ... 284.1365P . doi : 10.1126/science.284.5418.1365 . PMID 10334993 .
Bramlett KS, Yao S, Burris TP (dec 2000). "Korrelation mellan rekrytering av farnesoid X-receptorkoaktivator och repression av kolesterol-7-hydroxylasgen genom gallsyror". Molekylär genetik och metabolism . 71 (4): 609–15. doi : 10.1006/mgme.2000.3106 . PMID 11136553 .
Stegh AH, Barnhart BC, Volkland J, Algeciras-Schimnich A, Ke N, Reed JC, Peter ME (feb 2002). "Inaktivering av caspas-8 på mitokondrier av Bcl-xL-uttryckande MCF7-Fas-celler: roll för det bifunktionella apoptosregulatorproteinet" . Journal of Biological Chemistry . 277 (6): 4351–60. doi : 10.1074/jbc.M108947200 . PMID 11733517 .
Cui J, Heard TS, Yu J, Lo JL, Huang L, Li Y, Schaeffer JM, Wright SD (jul 2002). "Aminosyraresterna asparagin 354 och isoleucin 372 i human farnesoid X -receptor ger receptorn hög känslighet för kinodeoxikolat" . Journal of Biological Chemistry . 277 (29): 25963–9. doi : 10.1074/jbc.M200824200 . PMID 12004058 .
Huber RM, Murphy K, Miao B, Link JR, Cunningham MR, Rupar MJ, Gunyuzlu PL, Haws TF, Kassam A, Powell F, Hollis GF, Young PR, Mukherjee R, Burn TC (maj 2002). "Generering av flera farnesoid-X-receptorisoformer genom användning av alternativa promotorer". Gene . 290 (1–2): 35–43. doi : 10.1016/S0378-1119 (02) 00557-7 . PMID 12062799 .
Pineda Torra I, Claudel T, Duval C, Kosykh V, Fruchart JC, Staels B (feb 2003). "Gallsyror inducerar uttrycket av den humana peroxisomproliferatoraktiverade receptor-alfa-genen genom aktivering av den farnesoida X-receptorn" . Molekylär endokrinologi . 17 (2): 259–72. doi : 10.1210/me.2002-0120 . PMID 12554753 .
Anisfeld AM, Kast-Woelbern HR, Meyer ME, Jones SA, Zhang Y, Williams KJ, Willson T, Edwards PA (maj 2003). "Syndecan-1-uttryck regleras på ett isoformspecifikt sätt av farnesoid-X-receptorn" . Journal of Biological Chemistry . 278 (22): 20420–8. doi : 10.1074/jbc.M302505200 . PMID 12660231 .
Pircher PC, Kitto JL, Petrowski ML, Tangirala RK, Bischoff ED, Schulman IG, Westin SK (jul 2003). "Farnesoid X-receptor reglerar gallsyra-aminosyrakonjugering" . Journal of Biological Chemistry . 278 (30): 27703–11. doi : 10.1074/jbc.M302128200 . PMID 12754200 .
Zhao A, Lew JL, Huang L, Yu J, Zhang T, Hrywna Y, Thompson JR, de Pedro N, Blevins RA, Peláez F, Wright SD, Cui J (aug 2003). "Human kininogengen transaktiveras av den farnesoida X -receptorn" . Journal of Biological Chemistry . 278 (31): 28765–70. doi : 10.1074/jbc.M304568200 . PMID 12761213 .
Barbier O, Torra IP, Sirvent A, Claudel T, Blanquart C, Duran-Sandoval D, Kuipers F, Kosykh V, Fruchart JC, Staels B (juni 2003). "FXR inducerar UGT2B4 -enzymet i hepatocyter: en potentiell mekanism för negativ återkopplingskontroll av FXR -aktivitet". Gastroenterologi . 124 (7): 1926–40. doi : 10.1016/S0016-5085 (03) 00388-3 . PMID 12806625 .
Holt JA, Luo G, Billin AN, Bisi J, McNeill YY, Kozarsky KF, Donahee M, Wang DY, Mansfield TA, Kliewer SA, Goodwin B, Jones SA (jul 2003). "Definition av en ny tillväxtfaktorberoende signalkaskad för undertryckande av gallsyras biosyntes" . Gener och utveckling . 17 (13): 1581–91. doi : 10.1101/gad.1083503 . PMC 196131 . PMID 12815072 .
Claudel T, Inoue Y, Barbier O, Duran-Sandoval D, Kosykh V, Fruchart J, Fruchart JC, Gonzalez FJ, Staels B (aug 2003). "Farnesoid X -receptoragonister undertrycker hepatisk apolipoprotein CIII -expression". Gastroenterologi . 125 (2): 544–55. doi : 10.1016/S0016-5085 (03) 00896-5 . PMID 12891557 .
Hsiao PW, Fryer CJ, Trotter KW, Wang W, Archer TK (sep 2003). "BAF60a förmedlar kritiska interaktioner mellan kärnreceptorer och BRG1-kromatin-ombyggnadskomplexet för transaktivering" . Molekylär och cellulär biologi . 23 (17): 6210–20. doi : 10.1128/MCB.23.17.6210-6220.2003 . PMC 180928 . PMID 12917342 .
Ryan KK, Tremaroli V, Clemmensen C, Kovatcheva-Datchary P, Myronovych A, Karns R, Wilson-Pérez HE, Sandoval DA, Kohli R, Bäckhed F, Seeley RJ (maj 2014). "FXR är ett molekylärt mål för effekterna av vertikal ärm gastrektomi" . Natur . 509 (7499): 183–8. Bibcode : 2014Natur.509..183R . doi : 10.1038/nature13135 . PMC 4016120 . PMID 24670636 .

externa länkar

"Farnesoid X -receptor (NR1H4)" . Nuclear Receptor Resource . Arkiverad från originalet 2015-01-12 . Hämtad 2015-01-12 .
farnesoid+X-aktiverad+receptor vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)

Languages

In other projects