SYBR Green I - SYBR Green I

SYBR Green I
SYBR Green I.png
Namn
IUPAC -namn
N ', N' -dimetyl- N- [4-[(E)-(3-metyl- 1,3-bensotiazol -2-yliden) metyl] -1-fenylkinolin-1-ium-2-yl] -N -propylpropan-1,3-diamin
Identifierare
3D -modell ( JSmol )
CHEMBL
  • InChI = 1S/C32H37N4S/c1-5-20-35 (22-13-21-33 (2) 3) 31-23-25 ​​(24-32-34 (4) 29-18-11-12-19- 30 (29) 37-32) 27-16-9-10-17-28 (27) 36 (31) 26-14-7-6-8-15-26/h6-12,14-19,23- 24H, 5,13,20-22H2,1-4H3/q+1
    Nyckel: CGNLCCVKSWNSDG-UHFFFAOYSA-N
  • CCCN (CCCN (C) C) C1 = CC (= Cc2sc3ccccc3 [n+] 2C) c2ccccc2N1c1ccccc1
Egenskaper
C 32 H 37 N 4 S +
Molmassa 509,73 g / mol 
Löslighet Levereras normalt löst i dimetylsulfoxid
Om inte annat anges, ges data för material i deras standardtillstånd (vid 25 ° C [77 ° F], 100 kPa).
☒N verifiera  ( vad är   ?) kontrolleraY☒N
Infobox -referenser

SYBR Green I ( SG ) är en asymmetrisk cyaninfärgämne används som en nukleinsyra fläck i molekylärbiologi . Färgfamiljen SYBR produceras av Molecular Probes Inc. , som nu ägs av Thermo Fisher Scientific . SYBR Green I binder till DNA . Det resulterande DNA-färgämnet-komplexet absorberar bäst 497 nanometer blått ljus (λ max = 497 nm) och avger grönt ljus (λ max = 520 nm). Fläcken binder företrädesvis till dubbelsträngat DNA, men färgar enkelsträngat (ss) DNA med lägre prestanda. SYBR Green kan också färga RNA med lägre prestanda än ssDNA.

Ett prov av sillspermier färgade med SYBR Green i en kyvett upplyst av blått ljus i ett epifluorescensmikroskop . SYBR -grönt i provet binder till spermier -DNA: t och när det är bundet fluorescerar det och avger grönt ljus när det belyses av blått ljus
Spektrogram för SYBR Green I

Användningsområden

SYBR Green hittar användning inom flera områden inom biokemi och molekylärbiologi . Det används som ett färgämne för kvantifiering av dubbelsträngat DNA i vissa metoder för kvantitativ PCR . Det används också för att visualisera DNA i gelelektrofores . Högre koncentrationer av SYBR Green kan användas för att färga agarosgeler för att visualisera det närvarande DNA. Förutom att märka rena nukleinsyror kan SYBR Green också användas för märkning av DNA i celler för flödescytometri och fluorescensmikroskopi . I dessa fall kan RNas -behandling krävas för att minska bakgrunden från RNA i cellerna.

Säkerhet

SYBR Green I marknadsförs som ersättning för etidiumbromid , ett potentiellt humant mutagen , som både säkrare att arbeta med och är fritt från de komplexa avfallshanteringsfrågorna kring etidiumbromid. Varje liten molekyl som kan binda DNA med hög affinitet är emellertid ett möjligt cancerframkallande ämne , inklusive SYBR Green.

I en studie med Ames -testet , som mäter kemikaliers förmåga att orsaka mutationer, vid analys med samma koncentration var SYBR Green I i storleksordningen 30 gånger mindre mutagen än etidiumbromid (khalibanieh).

Liknande cyaninfärgämnen

Se även

Anteckningar och referenser