Lyssavirus -Lyssavirus

Lyssavirus
Färgad elektronmikrograf av australiensiskt fladdermus lyssavirus . De kulliknande föremålen är virionerna, och några av dem rinner ut från en cell.
Virusklassificering
(orankad):	Virus
Rike :	Riboviria
Rike:	Orthornavirae
Provins:	Negarnaviricota
Klass:	Monjiviricetes
Beställa:	Mononegavirales
Familj:	Rhabdoviridae
Släkte:	Lyssavirus
Arter
Aravan lyssavirus Australiskt fladdermus lyssavirus Bokeloh bat lyssavirus Duvenhage lyssavirus European bat 1 lyssavirus European bat 2 lyssavirus Gannoruwa bat lyssavirus Ikoma lyssavirus Irkut lyssavirus Khujand lyssavirus Kotalahti bat lyssavirus Lagos bat lyssavirus Lleida fladdermus lyssavirus Mokola lyssavirus Rabies lyssavirus Shimoni fladdermus lyssavirus Taiwan bat lyssavirus Västra kaukasiska fladdermus lyssavirus

Lyssavirus (från grekiska λύσσα lyssa "rage, raseri, rabies" och latinska vīrus ) är ett släkte av RNA -virus i familjen Rhabdoviridae , ordning Mononegavirales . Däggdjur, inklusive människor, kan fungera som naturliga värdar. Släktet Lyssavirus inkluderar rabiesvirus som traditionellt förknippas med sjukdomen med samma namn .

Taxonomi

Virologi

Strukturera

Lyssavirions är omslutna, med kulformade geometrier. Dessa virioner är cirka 75 nm breda och 180 nm långa. Lyssavirioner har spiralformad symmetri, så deras infektiösa partiklar har ungefär en cylindrisk form. Detta är typiskt för växtinfekterande virus. Virioner av virus som infekterar människor har vanligare kubisk symmetri och tar former som närmar sig vanliga polyeder .

Strukturen består av ett spetsigt yttre hölje , ett mittområde bestående av matrisprotein M och ett inre ribonukleokapsidkomplexområde , bestående av genomet associerat med andra proteiner.

Genom

Lyssavirus genomen består av en negativ-sense, enkelsträngat RNA- molekyl som kodar fem virala proteiner: polymeras L, matrisprotein M, fosfoprotein P, nukleoprotein N och glykoprotein G. genom är linjära, runt 11kb i längd.

Baserat på de senaste fylogenetisk bevis har lyssavirus kategoriserats i sju stora arter . Dessutom har ytterligare fem arter nyligen upptäckts: Västkaukasiskt fladdermusvirus, Aravan -virus, Khujand -virus, Irkut -virus och Shimoni -fladdermusvirus. Lyssavirus -släktet kan delas in i fyra fylogrupper baserat på DNA -sekvenshomologi. Phylogroup I inkluderar virus, såsom rabiesvirus, Duvenhage -virus, europeiskt fladdermus lyssavirus typ 1 och 2, australiensiskt fladdermus lyssavirus, Khujand -virus, Bokeloh bat lyssavirus, Irkut -virus och Aravan -virus. Phylogroup II innehåller Lagos fladdermusvirus, Mokola -virus och Shimoni -fladdermusvirus. Västkaukasiska fladdermus lyssavirus är det enda viruset som ingår i fylogrupp III. Ikoma lyssavirus och Lleida fladdermus lyssavirus är exempel i fylogrupp IV. Västkaukasiskt fladdermus lyssavirus klassificerades inom sin egen fylogrupp eftersom det är det mest divergerande lyssavirus som har upptäckts.

Evolution

Fyogenetiska studier tyder på att de ursprungliga värdarna för dessa virus var fladdermöss. Den större antigena mångfalden av lyssavirus från Afrika har lett till antagandet att Afrika var ursprunget till dessa virus. En undersökning av 153 virus som samlats in mellan 1956 och 2015 från olika geografiska platser har istället föreslagit ett palearktiskt ursprung (85% sannolikhet) för dessa virus. Datumuppskattningar (95% sannolikhet) för den senaste gemensamma förfadern var mycket breda - mellan 3 995 och 166 820 år före nutid - vilket tyder på att det finns ytterligare arbete att göra på detta område. Även om fladdermöss utvecklats i Palearktis, föddes deras ursprung från lyassavirusens miljontals år, vilket argumenterar mot deras medspeciering. Utvecklingshastigheten för N -genen i Afrika 2 -linjen har uppskattats till 3,75 × 10 ^-3 substitutioner per plats och år. Denna hastighet liknar den för andra RNA -virus.

Livscykel

Viral replikation är cytoplasmatisk. Inträde till värdcellen uppnås genom att de virala G-glykoproteinerna fästs till värdreceptorer, som förmedlar klatrinförmedlad endocytos . Replikation följer den negativa strängade RNA -virusreplikationsmodellen. Negativ strängad RNA -virustranskription, med användning av polymerasstammning , är metoden för transkription. Viruset lämnar värdcellen genom spirande och genom tubulärstyrd viral rörelse. Vilda däggdjur, särskilt fladdermöss och vissa köttätare, fungerar som naturliga värdar. Överföringsvägar sker vanligtvis via bett sår.

Testning

Från och med 2018 är det direkta fluorescerande antikroppstestet (DFA) fortfarande guldstandarden för att upptäcka lyssavirusinfektion. Sedan det nya årtusendet har PCR (RT-PCR) tester för omvänd transkription utvecklats för rabies men endast använts som ett bekräftande test. Realtids-PCR- baserade tester som har högre känslighet och objektiva diagnostiska trösklar och som gör att prover kan lagras vid rumstemperatur har varit lovande sedan 2005, men kräver en PCR-maskin i realtid och skickliga arbetare med erfarenhet av molekylär diagnostik. I en internationell utvärdering kan en enda TaqMan LN34 -analys detektera Lyssavirus med hög känslighet (99,90%) över släktet och hög specificitet (99,68%) jämfört med DFA -testet. Det kommer att bli det primära postdiagnostiska rabiesdiagnostiska testet där det är möjligt.

Epidemiologi

Klassiskt rabiesvirus förekommer i större delen av världen och kan bäras av alla varmblodiga däggdjur. De andra lyssavirusen har mycket mindre mångfald i bärare. Endast utvalda värdar kan bära var och en av dessa virala arter . Dessa andra arter är också särskilt endast för ett specifikt geografiskt område. Fladdermöss är kända för att vara en djurvektor för alla identifierade lyssavirus utom Mokola -viruset .

Se även

• Fladdermusburen virus

Referenser

Vidare läsning

externa länkar

• Rhabdoviridae
• Lyssavirus
• Viralzone : Lyssavirus
• ICTV