Haplogroup L0 (mtDNA) - Haplogroup L0 (mtDNA)

Haplogrupp L0
Möjlig tidpunkt för ursprung 130 till 200 ka
Möjlig ursprungsort Södra Afrika eller södra östra Afrika
Förfader L ( Mitochondrial Eve )
Ättlingar L0a'b'f'k, L0d
Definiera mutationer 263 !, 1048, 3516A, 5442, 6185, 9042, 9347, 10589, 12007, 12720

Haplogroup L0 är en human mitokondriell DNA (mtDNA) haplogrupp.

Ursprung

Regionen i Afrika där Tishkoff hittade den största nivån av mitokondriell mångfald (grön) och regionen Behar et al. postulerade den äldsta uppdelningen i den mänskliga befolkningen började inträffa (ljusbrun)

L0 är en av två grenar från den senaste gemensamma förfadern (MRCA) för den delade mänskliga moderlinjen. Haplogruppen består av fem huvudgrenar (L0a, L0b, L0d, L0f, L0k). Fyra av dem klassificerades ursprungligen i L1-underklasser, L1a, L1d, L1f och L1k.

År 2014 fann forntida DNA-analys av en 2330 år gammal manlig födoschelett i södra Afrika att provet tillhörde L0d2c1c mtDNA-subkladen. Den här moderns haplogrupp är idag närmast associerad med Ju, en undergrupp av det inhemska San-folket , vilket pekar på befolkningskontinuitet i regionen. År 2016 visade sig en torkad mumie från sen järnålder från Tuli-regionen i norra Botswana tillhöra haplogruppen L0.

MRCA (mtDNA) 
   L0   
 
 
 
 

 L0a

 
 

 L0b

 
 
 

 L0f

 
 
 

 L0k

 
 
 

 L0d

 
 
 L1-6 
 

L1

 
 

 L2-6

 
 
 

Distribution

Projicerad rumslig fördelning av haplogrupp L0 i Afrika.
Frekvenskartor för L0 (totalt), L0a, L0b, L0d, L0f och L0k

L0 finns oftast i Afrika söder om Sahara . Det når sin högsta frekvens i Khoisan- folket med i genomsnitt 73%. Några av de högsta frekvenserna är: Namibia ( ! Xun ) 79%, Sydafrika ( Khwe /! Xun) 83% och Botswana ( ! Kung ) 100%.

Haplogroup L0d finns bland Khoisan-grupper i södra Afrika närmare Khoidsidan med (efter L0k) mer sanid men är till stor del begränsad till Khoisan som helhet. L0d finns också ofta i den färgade befolkningen i Sydafrika och frekvenserna varierar från 60% till 71%. Detta illustrerar det enorma moderns bidrag från Khoisan-folket till den färgade befolkningen i Sydafrika.

Haplogroups L0k är den näst vanligaste haplogruppen i Khoisan-grupperna närmare Sanid-sidan med (efter L0d) mer Khoid men är till stor del begränsad till Khoisan som helhet. Även om den Khoisan-associerade L0d-haplogruppen hittades i höga frekvenser i den färgade befolkningen i Sydafrika, sågs inte L0k i två studier med stora grupper av färgade individer.

Haplogroup L0f finns i relativt små frekvenser i Tanzania , Östafrika bland Sandawe-folket i Tanzania som är äldre än Khoisan.

Haplogroup L0a är vanligast i sydostafrikanska befolkningar (25% i Moçambique ). Bland guinéerna har den en frekvens mellan 1% och 5%, med Balanta- gruppen uppvisad ökad frekvens på cirka 11%. Haplogroup L0a har ett paleolitiskt tidsdjup på cirka 33 000 år och nådde sannolikt Guinea mellan 10 000 och 4 000 år sedan. Det ses ofta i Mbuti och Biaka Pygmies . L0a finns med en frekvens på nästan 25% i Hadramawt ( Yemen ).

Haplogroup L0b finns i Etiopien .

Interaktioner mellan läkemedel och sjukdomar

Hos patienter som får läkemedlet stavudin för att behandla HIV är Haplogroup L0a2 associerat med en högre sannolikhet för perifer neuropati som en bieffekt.

Underklasser

Träd

Schematiskt träd av haplogruppen L0. MSA: Middle Stone Age , LSA: Later Stone Age , ka: för tusen år sedan.

Detta fylogenetiska träd av haplogrupp L0-underklasser är baserat på papperet av Mannis van Oven och Manfred Kayser Uppdaterat omfattande fylogenetiskt träd med global mänsklig mitokondriell DNA-variation och efterföljande publicerad forskning.

  • Senaste Common Ancestor (MRCA)
    • L0
      • L0d
        • L0d3
        • L0d1'2
          • L0d1
            • L0d1a
            • L0d1b
            • L0d1c
              • L0d1c1
          • L0d2
            • L0d2a'b
              • L0d2a
                • L0d2a1
              • L0d2b
            • L0d2c
              • L0d2c1c
      • L0a'b'f'k
        • L0k
          • L0k1
          • L0k2
        • L0a'b'f
          • L0f
            • L0f1
            • L0f2
              • L0f2a
              • L0f2b
          • L0a'b
            • L0a
              • L0a1
                • L0a1a
                  • L0a1a2
                • L0a1b
                  • L0a1b1
                    • L0a1b1a
                  • L0a1b2
                • L0a1c
                • L0a1d
              • L0a2
                • L0a2a
                  • L0a2a1
                    • L0a2a1a
                      • L0a2a1a1
                      • L0a2a1a2
                  • L0a2a2
                    • L0a2a2a
                • L0a2b
                  • L0a2ba
                • L0a2c
                • L0a2d
              • L0a3
              • L0a4
            • L0b

Se även

Fylogenetiskt träd av humant mitokondriellt DNA (mtDNA) haplogrupper

  Mitokondriell Eve ( L )    
L0 L1–6  
L1 L2   L3     L4 L5 L6
M N  
CZ D E G F   O A S R   Jag W X Y
C Z B F R0   före JT   P   U
HV JT K
H V J T

Referenser

externa länkar