GATA4 - GATA4

GATA4
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisökning: PDBe RCSB
Lista över PDB -ID -koder
	2M9W
Identifierare
Alias	GATA4 , GATA -bindande protein 4, ASD2, TACHD, VSD1, TOF
Externa ID: n	OMIM : 600576 MGI : 95664 HomoloGene : 1551 GeneCards : GATA4
Genläge ( mänskligt )
Chr.	Kromosom 8 (människa)
Slutet	11 760 002 bp
Genläge ( mus )
Chr.	Kromosom 14 (mus)
Slutet	63 271 692 bp
RNA -uttrycksmönster
	Mer referensuttrycksdata
Genontologi
Molekylär funktion	• DNA-bindning ; • sekvensspecifik DNA-bindning ; • co-SMAD-bindning ; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNA-bindande transkriptionsfaktoraktivitet ; • GO: 0001105 transkriptionskoaktiveringsaktivitet ; • zinkjonbindning ; • transkriptionsfaktor bindning ; • kromatinbindning ; • metalljonbindning ; • GO: 0001948 proteinbindning ; • GO: 0001158 cis-regulatorisk regionsekvensspecifik DNA-bindning ; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 DNA-bindande transkriptionsfaktoraktivitet, RNA-polymeras II- specifik ; • RNA-polymeras II-transkription regulatorisk region sekvensspecifik DNA-bindning ; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 DNA-bindande transkriptionsaktivatoraktivitet, RNA-polymeras II-specifik ; • proteinkinasbindning ; • NFAT-proteinbindning ; • GO: 0000980 RNA-polymeras II cis-regulatorisk regionsekvensspecifik DNA-bindning;
Cellulär komponent	• nukleoplasma ; • RNA -polymeras II transkriptionsregulatorkomplex ; • kärna ; • kärnkropp;
Biologisk process	• endodermutveckling ; • manlig gonadutveckling ; • reglering av transkription, DNA-mallad ; • ventrikelseptumutveckling ; • celltillväxt involverad i hjärtmuskelcellsutveckling ; • embryonlig förut morfogenes ; • endokardiell kuddeutveckling ; • differentiering av hjärtmuskelceller ; • cellcellsignalering ; • svar på mekanisk stimulans ; • blodkoagulering ; • transkription med RNA-polymeras II ; • transkription, DNA-mallad ; • positiv reglering av angiogenes ; • positiv reglering av transkription, DNA-mallad ; • hjärtslinga ; • förmaks septum morfogenes ; • svar på vitamin A ; • reglering av hjärtmuskelcellkontraktion ; • förmaks septum secundum morfogenes ; • förmaks septum primum morfogenes ; • intestinal epitelcellsdifferentiering ; • embryonalt hjärtrör främre/bakre mönster specifikation ; • positiv reglering av BMP signalväg ; • positiv reglering av kardioblast differentiering ; • positiv reglering av vaskulär endotel tillväxtfaktor produktion ; • negativ reglering av autophagy ; • hjärtventrikel morfogenes ; • hjärt högra ventrikeln morfogenes ; • svar på läkemedels ; • cellulärt svar på glukosstimulering ; • positiv reglering av transkription genom RNA-polymeras II ; • transdifferentiering ; • aortaklaffen morfogenes ; • hjärtutveckling ; • djurorgan morfogenes ; • vävnadsutveckling ; • cellutveckling ; • anatomiska strukturbildning involverat i morfogenes ; • matsmältningskanalen utveckling ; • hjärtmuskelvävnad utveckling ; • atrioventrikulärt ventilbildning ; • negativ reglering av hjärtmuskelcell apoptotiska processen ; • regleringen av proteinkinas B signalering ; • hjärtmuskelvävnad regenere ; • positiv reglering av ERK1 och ERK2 kaskad ; • negativ reglering av oxidativ stressinducerad celldöd ; • negativ reglering av apoptotisk signalväg;
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	2626
	14463
	ENSG00000136574 ; ENSG00000285109
	ENSMUSG00000021944
	P43694
	Q08369
	NM_001308093 ; NM_001308094 ; NM_002052 ; NM_001374273 ; NM_001374274
	NM_008092 ; NM_001310610
	NP_001295022 ; NP_001295023 ; NP_002043 ; NP_001361202 ; NP_001361203
	NP_001297539 ; NP_032118
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Transkriptionsfaktor GATA-4 är ett protein som hos människor kodas av GATA4- genen .

Fungera

Denna gen kodar för en medlem av GATA -familjen av zinkfinger -transkriptionsfaktorer . Medlemmar i denna familj känner igen GATA -motivet som finns i promotorerna för många gener. Detta protein antas reglera gener som är involverade i embryogenes och i myokarddifferentiering och funktion. Mutationer i denna gen har associerats med hjärtseptaldefekter såväl som reproduktionsdefekter.

GATA4 är en kritisk transkriptionsfaktor för korrekt däggdjurs hjärtutveckling och avgörande för överlevnad av embryot. GATA4 fungerar också i kombination med andra viktiga hjärttranskriptionsfaktorer, såsom Nkx2-5 och Tbx5. GATA4 uttrycks i både embryo och vuxna kardiomyocyter där det fungerar som en transkriptionell regulator för många hjärtgener och reglerar också hypertrofisk tillväxt av hjärtat. GATA4 främjar hjärtmorfogenes, överlevnad av kardiomyocyter och upprätthåller hjärtfunktionen i det vuxna hjärtat. Mutationer eller defekter i GATA4 -genen kan leda till en mängd olika hjärtproblem, inklusive medfödd hjärtsjukdom, onormal ventralveckning och defekter i hjärtseptum som separerar förmaken och ventriklarna och hypoplasi i det ventrikulära myokardiet. Som framgår av avvikelserna från radering av GATA4, är det viktigt för hjärtbildning och embryonas överlevnad under fosterutveckling. GATA4 är inte bara viktigt för hjärtutveckling, utan också utveckling och funktion hos däggdjursfostrets äggstock och bidrar till fosterhonad gonadal utveckling och mutationer kan leda till defekter i reproduktiv utveckling. GATA4 har också upptäckts ha en integrerad roll för att kontrollera de tidiga stadierna av bukspottkörteln och leverutvecklingen.

GATA4 regleras genom autofagi-lysosomvägen i eukaryota celler. Vid cellulär åldrande hämmar ATM och ATR p62, en autofageadapter som ansvarar för selektiv autofagi av GATA4. Hämning av p62 leder till ökade GATA4-nivåer, vilket resulterar i NF-kB-aktivering och efterföljande SASP- induktion.

Atrioventrikulär ventilbildning

GATA4 -uttryck under hjärtutveckling har visat sig vara avgörande för korrekt atrioventrikulär bildning och funktion. Endokardceller genomgår epitel till mesenkymala övergångar (EMT) till AV -kuddarna under utvecklingen. Deras spridning och fusion leder till uppdelning av det ventrikulära inloppet i två olika passager med två AV -ventiler, och de antas vara påverkade av GATA4 -transkriptionsfaktorn. GATA4-inaktivering, med GATA4-null-möss, leder till nedreglering av Erbb3 och förändrat Erk-uttryck, två andra viktiga molekyler i EMT och ventrikulär inloppsseparation. Detta har visat sig leda till perikardiell effusion och perifer blödning hos E12.5 -möss, som viker efter hjärtsvikt före avvänjningsåldern. Dessa data kan ha viktiga konsekvenser för humanmedicin genom att föreslå att mutationer med GATA4 -transkriptionsfaktorn kan vara ansvariga för AV -kuddfel hos människor med felaktig septalbildning som leder till medfödd hjärtsjukdom.

Interaktioner

GATA4 har visat sig interagera med NKX2-5 , Tbx5 , Serum responsfaktor HAND2 och HDAC2 .

GATA4 har också visat sig interagera med Erbb3, FOG-1 och FOG-2.

Klinisk relevans

Mutationer i denna gen har associerats med fall av medfödd membranbråck . Atriella septaldefekter, tetralogi av Fallot och ventrikelseptaldefekter associerade med GATA4 -mutation sågs också hos sydindiska patienter.

Se även

GATA -transkriptionsfaktor

Referenser

Vidare läsning

Evans T, Reitman M, Felsenfeld G (1988). "En erytrocytspecifik DNA-bindande faktor känner igen en regulatorisk sekvens som är gemensam för alla kycklingglobingener" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 85 (16): 5976–80. Bibcode : 1988PNAS ... 85.5976E . doi : 10.1073/pnas.85.16.5976 . PMC 281888 . PMID 3413070 .
Huang WY, Cukerman E, Liew CC (1995). "Identifiering av ett GATA-motiv i hjärt-alfa-myosin-tungkedjekodande genen och isolering av ett humant GATA-4-cDNA". Gene . 155 (2): 219–23. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 00893-W . PMID 7721094 .
Yamagata T, Nishida J, Sakai R, et al. (1995). "Av de GATA-bindande proteinerna reglerar endast GATA-4 selektivt den humana interleukin-5-genpromotorn i interleukin-5-producerande celler som uttrycker flera GATA-bindande proteiner" . Mol. Cell. Biol . 15 (7): 3830–9. doi : 10.1128/MCB.15.7.3830 . PMC 230622 . PMID 7791790 .
Molkentin JD, Kalvakolanu DV, Markham BE (1994). "Transkriptionsfaktor GATA-4 reglerar hjärtmuskel-specifikt uttryck av alfa-myosin-tungkedjegenen" . Mol. Cell. Biol . 14 (7): 4947–57. doi : 10.1128/MCB.14.7.4947 . PMC 358867 . PMID 8007990 .
Arceci RJ, King AA, Simon MC, et al. (1993). "Mus GATA-4: en retinsyrainducerbar GATA-bindande transkriptionsfaktor uttryckt i endodermiskt härledda vävnader och hjärta" . Mol. Cell. Biol . 13 (4): 2235–46. doi : 10.1128/MCB.13.4.2235 . PMC 359544 . PMID 8455608 .
Huang WY, Heng HH, Liew CC (1997). "Tilldelning av den humana GATA4 -genen till 8p23.1 → p22 med användning av fluorescens in situ hybridiseringsanalys". Cytogenet. Cell Genet . 72 (2–3): 217–8. doi : 10.1159/000134194 . PMID 8978781 .
Herzig TC, Jobe SM, Aoki H, et al. (1997). "Angiotensin II typ1a-receptorgenuttryck i hjärtat: AP-1 och GATA-4 deltar i svaret på trycköverbelastning" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (14): 7543–8. Bibcode : 1997PNAS ... 94.7543H . doi : 10.1073/pnas.94.14.7543 . PMC 23858 . PMID 9207128 .
Durocher D, Charron F, Warren R, et al. (1997). "Hjärttranskriptionsfaktorerna Nkx2-5 och GATA-4 är ömsesidiga kofaktorer" . EMBOJ . 16 (18): 5687–96. doi : 10.1093/emboj/16.18.5687 . PMC 1170200 . PMID 9312027 .
Molkentin JD, Lu JR, Antos CL, et al. (1998). "En kalcineurinberoende transkriptionsväg för hjärthypertrofi" . Cell . 93 (2): 215–28. doi : 10.1016/S0092-8674 (00) 81573-1 . PMC 4459646 . PMID 9568714 .
Svensson EC, Tufts RL, Polk CE, Leiden JM (1999). "Molekylär kloning av FOG-2: en modulator för transkriptionsfaktor GATA-4 i kardiomyocyter" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (3): 956–61. Bibcode : 1999PNAS ... 96..956S . doi : 10.1073/pnas.96.3.956 . PMC 15332 . PMID 9927675 .
Tremblay JJ, Viger RS (1999). "Transkriptionsfaktor GATA-4 förstärker Müllerian-hämmande substansgen-transkription genom en direkt interaktion med kärnreceptorn SF-1". Mol. Endokrinol . 13 (8): 1388–401. doi : 10.1210/me.13.8.1388 . PMID 10446911 .
Lin L, Aggarwal S, Glover TW, et al. (2000). "En minimal kritisk region av 8p22-23-amplikonet i esofageala adenokarcinom definierat med hjälp av sekvensmärkt platsamplifieringskartläggning och kvantitativ polymeraskedjereaktion inkluderar GATA-4-genen". Cancer Res . 60 (5): 1341–7. PMID 10728696 .
Morin S, Charron F, Robitaille L, Nemer M (2000). "GATA-beroende rekrytering av MEF2-proteiner till målpromotörer" . EMBOJ . 19 (9): 2046–55. doi : 10.1093/emboj/19.9.2046 . PMC 305697 . PMID 10790371 .
Zhu W, Shiojima I, Hiroi Y, et al. (2001). "Funktionella analyser av tre Csx/Nkx-2.5-mutationer som orsakar mänsklig medfödd hjärtsjukdom" . J. Biol. Chem . 275 (45): 35291–6. doi : 10.1074/jbc.M000525200 . PMID 10948187 .
Belaguli NS, Sepulveda JL, Nigam V, et al. (2000). "Hjärtvävnadsberikade faktorer serumresponsfaktor och GATA-4 är ömsesidiga samregulatorer" . Mol. Cell. Biol . 20 (20): 7550–8. doi : 10.1128/MCB.20.20.7550-7558.2000 . PMC 86307 . PMID 11003651 .
Morin S, Paradis P, Aries A, Nemer M (2001). "Serumsvarfaktor-GATA ternärt komplex som krävs för kärnsignalering med en G-proteinkopplad receptor" . Mol. Cell. Biol . 21 (4): 1036–44. doi : 10.1128/MCB.21.4.1036-1044.2001 . PMC 99558 . PMID 11158291 .
Crispino JD, Lodish MB, Thurberg BL, et al. (2001). "Korrekt koronar vaskulär utveckling och hjärtmorfogenes beror på interaktion mellan GATA-4 och FOG-kofaktorer" . Gener Dev . 15 (7): 839–44. doi : 10.1101/gad.875201 . PMC 312667 . PMID 11297508 .
Dai YS, Markham BE (2001). "p300 Fungerar som en koaktiverare av transkriptionsfaktor GATA-4" . J. Biol. Chem . 276 (40): 37178–85. doi : 10.1074/jbc.M103731200 . PMID 11481322 .
Liang Q, Wiese RJ, Bueno OF, et al. (2001). "Transkriptionsfaktorn GATA4 aktiveras av extracellulär signalreglerad kinas 1- och 2-medierad fosforylering av serin 105 i kardiomyocyter" . Mol. Cell. Biol . 21 (21): 7460–9. doi : 10.1128/MCB.21.21.7460-7469.2001 . PMC 99918 . PMID 11585926 .

externa länkar

GATA4+protein,+människa vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
Översikt över all strukturinformation som finns tillgänglig i PDB för UniProt : P43694 (transkriptionsfaktor GATA-4) på PDBe-KB .

Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine , som är offentligt .

Languages

In other projects