ETS -transkriptionsfaktorfamilj - ETS transcription factor family
| Ets-domän | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktur för Ets-1 DNA-bindande autoinhibition.
| |||||||||||
| Identifierare | |||||||||||
| Symbol | Ets | ||||||||||
| Pfam | PF00178 | ||||||||||
| Pfam -klan | CL0123 | ||||||||||
| InterPro | IPR000418 | ||||||||||
| SMART | SM00413 | ||||||||||
| PROSIT | PDOC00374 | ||||||||||
| SCOP2 | 1r36 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
| |||||||||||
Inom området för molekylärbiologi , den ETS ( E26 transformationsspecifika eller E-tjugosex. (Erytroblast Transformation Specifik) ) familj är en av de största familjerna av transkriptionsfaktorer och är unikt för djur . Det finns 29 gener hos människor, 28 i musen, 10 i Caenorhabditis elegans och 9 i Drosophila . Den grundande medlemmen i denna familj identifierades som en gen som transducerades av leukemiviruset, E26. Familjemedlemmarna har varit inblandade i utvecklingen av olika vävnader samt cancerframsteg.
Underfamiljer
ETS -familjen (Erythroblast Transformation Specific) är indelad i 12 underfamiljer, som listas nedan:
| Underfamilj | Däggdjur familjemedlemmar | Ryggradslösa orthologer |
|---|---|---|
| ÄLVA | ELF1 , ELF2 (NERF), ELF4 (MEF) | |
| ELG | GABPα | ELG |
| ERG | ERG , FLI1 , FEV | |
| ERF | ERF (PE2), ETV3 (PE1) | |
| ESE | ELF3 (ESE1/ESX), ELF5 (ESE2), ESE3 (EHF) | |
| ETS | ETS1 , ETS2 | SPETSIG |
| PDEF | SPDEF (PDEF/PSE) | |
| PEA3 | ETV4 (PEA3/E1AF), ETV5 (ERM), ETV1 (ER81) | |
| ER71 | ETV2 (ER71) | |
| SPI | SPI1 (PU.1), SPIB , SPIC | |
| TCF | ELK1 , ELK4 (SAP1), ELK3 (NET/SAP2) | LIN |
| TEL | ETV6 (TEL), ETV7 (TEL2) | YAN |
Strukturera
Alla ETS (Erythroblast Transformation Specific) familjemedlemmar identifieras genom en mycket bevarad DNA-bindande domän , ETS-domänen , som är en bevingad helix-turn-helix- struktur som binder till DNA-platser med en central GGA (A/T) DNA-sekvens. Förutom DNA-bindande funktioner tyder bevis på att ETS-domänen också är involverad i protein-protein-interaktioner . Det finns begränsad likhet utanför ETS -DNA -bindande domän.
Andra domäner finns också och varierar från ETS -medlem till ETS -medlem, inklusive Pointed -domänen, en underklass av SAM -domänfamiljen.
Fungera
ETS -familjen finns i hela kroppen och är involverad i en mängd olika funktioner, inklusive reglering av celldifferentiering , cellcykelkontroll , cellmigration , cellproliferation , apoptos (programmerad celldöd) och angiogenes .
Flera ETS -faktorer har visat sig vara associerade med cancer, till exempel genom genfusion . Till exempel fusioneras ERG ETS -transkriptionsfaktorn till EWS -genen, vilket resulterar i ett tillstånd som kallas Ewings sarkom . Fusion av TEL till JAK2- proteinet resulterar i tidig pre-B akut lymfoid leukemi. ERG och ETV1 är kända genfusioner som finns i prostatacancer .
Dessutom har ETS-faktorer, t.ex. ryggradsdjur Etv1 och ryggradslösa Ast-1, visat sig vara viktiga aktörer i specifikationen och differentieringen av dopaminerga neuroner i både C. elegans och luktlökar hos möss .
Handlingssätt
Bland medlemmar av ETS-familjen finns det omfattande bevarande i den DNA-bindande ETS-domänen och därför mycket redundans i DNA-bindning. Man tror att interaktioner med andra proteiner (t.ex.: Modulator av aktiviteten hos Ets som kallas Mae) är ett sätt på vilket specifik bindning till DNA uppnås. Transkriptionsfaktor Ets är en plats för signaleringskonvergens. ETS -faktorer fungerar som transkriptionella repressorer , transkriptionella aktivatorer eller båda.
Referenser
Vidare läsning
- Blair DG, Athanasiou M (2000). "Ets och retrovirus - transduktion och aktivering av medlemmar av Ets onkogenfamiljen vid viral onkogenes" . Onkogen . 19 (55): 6472–81. doi : 10.1038/sj.onc.1204046 . PMID 11175363 .
- Li R, Pei H, Watson DK (2000). "Reglering av Ets -funktion genom protein -protein -interaktioner" . Onkogen . 19 (55): 6514–23. doi : 10.1038/sj.onc.1204035 . PMID 11175367 .
- Mimeault M (2000). "Strukturfunktionsstudier av ETS-transkriptionsfaktorer". Crit Rev Oncog . 11 (3–4): 227–53. doi : 10.1615/critrevoncog.v11.i34.20 . PMID 11358268 .
- Oikawa T, Yamada T (2003). "Molekylärbiologi av Ets -familjen av transkriptionsfaktorer". Gene . 303 : 11–34. doi : 10.1016/S0378-1119 (02) 01156-3 . PMID 12559563 .
- Sementchenko VI, Watson DK (2000). "Ets målgener: förflutna, nutid och framtid" . Onkogen . 19 (55): 6533–48. doi : 10.1038/sj.onc.1204034 . PMID 11175369 .
- Verger A, Duterque-Coquillaud M (2002). "När Ets transkriptionsfaktorer möter sina partners". BioEssays . 24 (4): 362–70. doi : 10.1002/bies.10068 . PMID 11948622 .
- Nunn M, Seeburg P, Moscovici C, Duesberg P (1983). "Trepartsstruktur för aviär erytroblastosvirus E26 -transformerande gen". Natur . 306 (5941): 391–95. Bibcode : 1983Natur.306..391N . doi : 10.1038/306391a0 . PMID 6316155 . S2CID 4302399 .