Litet GTPase - Small GTPase
Litet monomert GTPas | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifierare | |||||||||
EG-nummer | 3.6.5.2 | ||||||||
Databaser | |||||||||
IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
BRENDA | BRENDA-post | ||||||||
EXPASy | Utsikt över NiceZyme | ||||||||
KEGG | KEGG-post | ||||||||
MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
PRIAM | profil | ||||||||
FBF- strukturer | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
|
Små GTPaser ( EC 3.6.5.2 ), även kända som små G-proteiner , är en familj av hydrolasinhibitorer enzymer som kan binda och hydrolyserar guanosintrifosfat (GTP). De är en typ av G-protein som finns i cytosolen som är homolog med alfa-underenheten av heterotrimera G-proteiner , men till skillnad från alfa-underenheten av G-proteiner kan ett litet GTPas fungera oberoende av varandra som ett hydrolasenzym för att binda till och hydrolysera en guanosintrifosfat (GTP) för att bilda guanosindifosfat (BNP). De mest kända medlemmarna är Ras GTPases och därför kallas de ibland Ras subfamily GTPases .
Ett typiskt G-protein är aktivt när det är bundet till GTP och inaktivt när det är bundet till BNP (dvs. när GTP hydrolyseras till BNP). BNP kan sedan ersättas med gratis GTP. Därför kan ett G-protein slås på och av. GTP-hydrolys accelereras av GTPas-aktiverande proteiner (GAP), medan GTP-utbyte katalyseras av guaninnukleotidutbytesfaktorer (GEF). Aktivering av en GEF aktiverar typiskt dess besläktade G-protein, medan aktivering av en GAP resulterar i inaktivering av det besläktade G-proteinet. Guanosinnukleotiddissociationsinhibitorer (GDI) bibehåller små GTPaser i inaktivt tillstånd.
Små GTPaser reglerar en mängd olika processer i cellen , inklusive tillväxt, celldifferentiering , cellrörelse och lipid vesikler transporter.
Ras-superfamiljen
Det finns mer än hundra proteiner i Ras-familjen. Baserat på struktur, sekvens och funktion är Ras superfamiljen uppdelad i fem huvudfamiljer, (Ras, Rho , Ran , Rab och Arf GTPases). Själva Ras-familjen är vidare uppdelad i 6 underfamiljer: Ras , Ral , Rit , Rap , Rheb och Rad . Miro har nyligen bidragit till superfamiljen.
Varje underfamilj delar den gemensamma kärn-G-domänen, som ger väsentlig GTPas- och nukleotidutbytesaktivitet.
Den omgivande sekvensen hjälper till att bestämma den funktionella specificiteten för det lilla GTPaset, till exempel 'Insert Loop', som är gemensamt för Rho-underfamiljen, bidrar specifikt till bindning till effektorproteiner som IQGAP och WASP .
Ras-familjen är generellt ansvarig för cellproliferation, Rho för cellmorfologi, Ran för kärntransport och Rab och Arf för vesikeltransport.
Se även
Referenser
externa länkar
- Små + GTPaser vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)