NeuroNames - NeuroNames

NeuroNames
BrainInfo Skärmdump 2014-02-01.png
Innehåll
Beskrivning Omfattande hierarkisk nomenklatur för strukturer i primärhjärnan (mänsklig och makak)
Datatyper
fångade
Neuroanatomi
Tillgång
Hemsida http://braininfo.rprc.washington.edu/
Diverse
Licens CC-BY icon.svg
Creative Commons Attribution 3.0 Unported-licens

NeuroNames är en integrerad nomenklatur för strukturer i hjärnan och ryggmärgen hos de fyra arter som mest studerats av neurovetenskapsmän: människa , makak , råtta och mus . Det erbjuder en standard, kontrollerad ordförråd med vanliga namn för strukturer, som är lämplig för entydig neuroanatomisk indexering av information i digitala databaser. Termer i standardordförrådet har valts för att underlätta uttal, mnemoniskt värde och frekvens för användning i de senaste neurovetenskapliga publikationerna. Strukturer och deras relationer till varandra definieras i termer av standardordförrådet. För närvarande innehåller NeuroNames standardnamn, synonymer och definitioner av cirka 2500 neuroanatomiska enheter.

Nomenklaturen upprätthålls av University of Washington och är kärnkomponenten i ett verktyg som heter "BrainInfo". BrainInfo hjälper en att identifiera strukturer i hjärnan. Man kan antingen söka efter ett strukturnamn eller lokalisera strukturen i en hjärnatlas och få information som dess placering i den klassiska hjärnhierarkin, bilder av strukturen, vilka celler den har, dess kopplingar och gener som uttrycks där. Information kan nås med någon av cirka 16 000 synonymer på åtta språk.

NeuroNames är en källordlista för Metathesaurus of the Unified Medical Language System . Det beskrivs djupgående i följande tre vetenskapliga artiklar :

  • DM Bowden & RF Martin (mars 1995). "NeuroNames hjärnhierarki". NeuroImage . 2 (1): 63–83. doi : 10.1006 / nimg.1995.1009 . PMID   9410576 . S2CID   24847350 .
  • DM Bowden & MF Dubach (2003). "NeuroNames 2002". Neuroinformatik . 1 (1): 43–59. doi : 10.1385 / NI: 1: 1: 043 . PMID   15055392 . S2CID   12575028 .
  • DM Bowden; E. Sång; J. Kosheleva; MF Dubach (2011). "NeuroNames: An Ontology for the BrainInfo Portal to Neuroscience on the Web" . Neuroinformatik . 10 (1): 97–114. doi : 10.1007 / s12021-011-9128-8 . PMC   3247656 . PMID   21789500 .

Se även

externa länkar