HLA -C - HLA-C

HLA-C
Tillgängliga strukturer
PDB	Human UniProt -sökning: PDBe RCSB
Lista över PDB -ID -koder
	3BZF , %% s 4NT6 , %% s 1EFX , %% s 1IM9 , 1QQD
Identifierare
Alias	HLA-C , D6S204, HLA-JY3, HLC-C, PSORS1, större histokompatibilitetskomplex, klass I, C, MHC
Externa ID: n	OMIM : 142840 HomoloGene : 133080 GeneCards : HLA-C
Genläge ( mänskligt )
Chr.	Kromosom 6 (människa)
Slutet	31 272 130 bp
RNA -uttrycksmönster
	Mer referensuttrycksdata
Genontologi
Molekylär funktion	• bindning av peptidantigen ; • GO: 0001948 proteinbindning;
Cellulär komponent	• integrerad komponent i membran ; • fagocytiskt vesikelmembran ; • Golgi -apparat ; • tidigt endosommembran ; • membran ; • Golgimembran ; • plasmamembran ; • cellyta ; • endoplasmatisk retikulum ; • MHC klass I proteinkomplex ; • ER till Golgi transport vesikelmembran ; • integrerad komponent i lumenal sida av endoplasmatiskt retikulamembran ; • extracellulärt exosom ; • sekretoriskt granulatmembran ; • återvinning av endosommembran;
Biologisk process	• antigenbehandling och presentation ; • antigenbehandling och presentation av exogent peptidantigen via MHC klass I, TAP-beroende ; • immunsystemsprocess ; • interferon-gammedierad signalväg ; • antigenbehandling och presentation av peptidantigen via MHC klass I ; • antigenbehandling och presentation av exogent peptidantigen via MHC klass I, TAP-oberoende ; • typ I interferonsignaleringsväg ; • immunsvar ; • reglering av immunsvar ; • GO: 0022415 viral process ; • neutrofil degranulering;
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	3107
	n/a
ENSG00000204525 ; ENSG00000233841 ; ENSG00000228299 ; ENSG00000225691 ; ENSG00000206435;
	ENSG00000237022 ; ENSG00000206452
	n/a
	P10321
	n/a
	NM_002117 ; NM_001243042
	n/a
	NP_001229971 ; NP_002108
	n/a
	Wikidata
Visa/redigera människa

HLA-C tillhör MHC (humant = HLA) klass I tung kedja-receptorer. C-receptorn är en heterodimer som består av en HLA-C-mogen genprodukt och β2-mikroglobulin . Den mogna C -kedjan är förankrad i membranet. MHC klass I-molekyler, liksom HLA-C, uttrycks i nästan alla celler och presenterar små peptider för immunsystemet som undersöker icke-självpeptider.

HLA-C är ett lokus på kromosom 6, som kodar för många HLA-C-alleler som är klass-I MHC-receptorer. HLA-C, lokaliserat proximalt till HLA-B-locus, är beläget på den distala änden av HLA-regionen. De flesta HLA-C: B-haplotyperna är i stark kopplingsobalans och många är lika gamla som själva människans art.

Sjukdomsföreningar

Efter serotyp

Cw1: multinodulära struma

Av allel

C*16: B kronisk lymfatisk leukemi

Nomenklatur

C*01

Cw1 -serotyp : C*01: 02 och C*01: 09
Cw11
C *01: 04 till *01: 08

C*02

Cw2 -serotyp : C *02: 02 och *02: 08
C *02: 03 till *02: 07 och 02:09

C*03

Cw9 -serotyp : C*03: 03
Cw10 -serotyp : C *03: 02, *03: 04 och *03: 06
Cw3 -serotyp : C*03: 07
C*03: 05 och 03:08

C*04

Cw4 -serotyp : C *0401, *0407 och *0410

C*05

Cw5 -serotyp : C *05: 01 och *05: 02
C *05: 03 till *05: 06 och *05: 08 till *05: 10

C*06

Cw6 -serotyp : C *06: 02 och *06: 05
C *06: 03, *06: 04 och *06: 06 till *06: 11
Cw7 -serotyp : C *07: 01 till *07: 06, *07: 12, *07: 14, *07: 16
C *07: 07 till *07: 11, *07: 13, *07: 15 och *07: 17 till *07: 29

C*08

Cw8 -serotyp : C *08: 01, *08: 02 och *08: 03
C *08: 05 till *08: 12

Andra

C *12: 02 till *12:15
C *14: 02 till *14: 05
C *15: 01 till *15:11
C *16: 01 till *16: 06
C *17: 01 till *17: 03
C *18: 01 och *18: 02

Vanlig haplotyp

Cw4-B35 (västra Afrika till indianer) Cw7-B7 (västra Eurasien, Sydafrika) Cw7-B8 (västra Eurasien) Cw1-B46 (Kina, Indokina) Cw5-B44 (västra Eurasien)

Interaktioner

HLA-C har visat sig interagera med:

KIR2DL1 ,
LILRA3
Leukocytimmunoglobulinliknande receptorfamilj , särskilt den aktiverande receptorn LILRA1

Referenser

Vidare läsning

Geyer M, Fackler OT, Peterlin BM (2001). "Struktur-funktionsrelationer i HIV-1 Nef" . EMBO Rep . 2 (7): 580–5. doi : 10.1093/embo-reports/kve141 . PMC 1083955 . PMID 11463741 .
Greenway AL, Holloway G, McPhee DA, Ellis P, Cornall A, Lidman M (2004). "HIV-1 Nef-kontroll av cellsignalmolekyler: flera strategier för att främja virusreplikation". J. Biosci . 28 (3): 323–35. doi : 10.1007/BF02970151 . PMID 12734410 . S2CID 33749514 .
Bénichou S, Benmerah A (2003). "[HIV nef- och Kaposi-sarkomassocierade virus K3/K5-proteiner:" parasiter "i endocytosvägen]" . Med Sci (Paris) . 19 (1): 100–6. doi : 10.1051/medsci/2003191100 . PMID 12836198 .
Leavitt SA, SchOn A, Klein JC, Manjappara U, Chaiken IM, Freire E (2004). "Interaktioner mellan HIV-1-proteiner gp120 och Nef med cellulära partner definierar ett nytt allosteriskt paradigm". Curr. Proteinpept. Sci . 5 (1): 1–8. doi : 10.2174/1389203043486955 . PMID 14965316 .
Tolstrup M, Ostergaard L, Laursen AL, Pedersen SF, Duch M (2004). "HIV/SIV -flykt från immunövervakning: fokusera på Nef". Curr. HIV Res . 2 (2): 141–51. doi : 10.2174/1570162043484924 . PMID 15078178 .
Joseph AM, Kumar M, Mitra D (2005). "Nef:" nödvändig och verkställande faktor "vid HIV -infektion". Curr. HIV Res . 3 (1): 87–94. doi : 10.2174/1570162052773013 . PMID 15638726 .
Anderson JL, Hope TJ (2005). "HIV -tillbehörsproteiner och överlever värdcellen". Nuvarande hiv/aids -rapporter . 1 (1): 47–53. doi : 10.1007/s11904-004-0007-x . PMID 16091223 . S2CID 34731265 .

Languages

In other projects