GATA6 - GATA6

GATA6
Identifierare
Alias	GATA6 , GATA -bindande protein 6
Externa ID: n	OMIM : 601656 MGI : 107516 HomoloGene : 68449 GeneCards : GATA6
Genläge ( mänskligt )
Chr.	Kromosom 18 (människa)
Slutet	22202528 bp
Genläge ( mus )
Chr.	Kromosom 18 (mus)
Slutet	11 085 635 bp
Genontologi
Molekylär funktion	• DNA-bindning ; • sekvensspecifik DNA-bindning ; • RNA-polymeras II-transkription regulatorisk region sekvensspecifik DNA-bindning ; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 DNA-bindande transkriptionsaktivatoraktivitet, RNA-polymeras II-specifik ; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNA-bindande transkriptionsfaktoraktivitet ; • zinkjonbindning ; • transkriptionsfaktorbindning ; • kromatinbindning ; • metalljonbindning ; • GO: 0001948 proteinbindning ; • transkriptionsfaktoraktivitet , RNA-polymeras II distal förstärkarsekvensspecifik bindning ; • proteinkinasbindning ; • GO: 0000980 RNA-polymeras II cis-regulatorisk region sekvensspecifik DNA-bindning ; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 DNA-bindande transkriptionsfaktoraktivitet, RNA polymeras II-specifik ; • GO: 0001158 cis-regulatorisk regionsekvensspecifik DNA-bindning;
Cellulär komponent	• transkriptionsregulatorkomplex ; • nukleoplasma ; • kärna ; • kärnmembran;
Biologisk process	• cellulärt protein metabolisk process ; • klubb celldifferentiering ; • manliga gonad utveckling ; • reglering av transkription, DNA-styrd ; • epitelial celldifferentiering ; • endodermalt celldifferentiering ; • negativ reglering av transformerande tillväxtfaktor beta 1-produktion ; • hjärtmuskelvävnad utveckling ; • pankreatisk En celldifferentiering ; • hjärt muskelcelldifferentiering ; • differentiering av hjärtkärlens glatta muskelmassa ; • cellrespons på BMP -stimulans ; • bestämning av endodermal cell öde ; • blodkoagulation ; • i livmoders embryonisk utveckling ; • negativ reglering av transkription av RNA -polymeras II ; • transkription av RNA -polymeras II ; • negativ reglering av transformerande tillväxt faktor beta2-produktion ; • rörmorfogenes ; • negativ reglering av apoptotisk process ; • differentiering av glatta muskelceller ; • transkription, DNA-mallad ; • positiv reglering av angiogenes ; • utflödeskanals septummorfogenes ; • svar på östrogen ; • djurorganbildning ; • positiv reglering tion av hjärtmuskelcellproliferation ; • hjärtmuskel-hypertrofi som svar på stress ; • intestinal epitelial celldifferentiering ; • positiv reglering av BMP signalväg ; • positiv reglering av cardioblast differentiering ; • reglering av genuttryck ; • fosfolipid metabolisk process ; • leverutveckling ; • bukspottkörteln utveckling ; • svar på tillväxtfaktor ; • typ II-pneumocytdifferentiering ; • lungsackulutveckling ; • negativ reglering av transkription, DNA-mallad ; • cellrespons på hypoxi ; • typ B-bukspottkörtelcelldifferentiering ; • cellulärt svar på gonadotropin stimulans ; • svar på läkemedel ; • positiv reglering av transkription med RNA-polymeras II ; • positiv reglering av transkription, DNA-mallad ; • positiv reglering av hjärtmuskelns myoblastproliferation ; • hjärtutveckling ; • djurorganmorfogenes ; • vävnadsutveckling ; • cellutveckling ; • anatomisk strukturbildning involverad i morfogenes ; • utveckling av matsmältningskanalen;
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	2627
	14465
	ENSG00000141448
	ENSMUSG00000005836
	Q92908
	F61169
	NM_005257
	NM_010258
	NP_005248
	NP_034388
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Transkriptionsfaktor GATA-6 , även känd som GATA-bindande faktor 6 (GATA6), är protein som hos människor kodas av GATA6- genen . Genprodukten binder företrädesvis (A/T/C) GAT (A/T) (A) i konsensusbindningssekvensen .

Klinisk signifikans

Mutationer i genen har kopplats till bukspottkörteln agenes och medfödda hjärtfel .

Lung endodermal epitelutveckling

GATA-6, en zinkfinger-transkriptionsfaktor , är viktig vid endodermal differentiering av organvävnader. Det indikeras också vid korrekt lungutveckling genom att kontrollera de sena differentieringsstadierna av alveolärt epitel och aquaporin-5 promotoraktivering. Dessutom har GATA-6 kopplats till produktionen av LIF, ett cytokin som uppmuntrar proliferation av endodermala embryonala stamceller och blockerar tidig epiblastdifferentiering. Om den lämnas oreglerad i det utvecklande embryot, bidrar denna cytokinproduktion och kemiska signal till de fenotyper som diskuteras vidare nedan.

Vid avbrott i GATA-6 i ett embryo hämmas den distala lungepitelutvecklingen i transgena mössmodeller Stamcellerna eller stamcellerna för alveolära epitelvävnader utvecklas och specificeras på lämpligt sätt, men ytterligare differentiering sker inte. Den distala-proximala bronkioleutvecklingen påverkas också, vilket resulterar i en minskad mängd luftvägsbytesplatser.

Detta förgreningsunderskott, som kommer att orsaka bilateral pulmonell hypoplasi efter födseln, har lokalt förknippats med områden som saknar differentierat alveolärt epitel, vilket innebär att denna fenotyp är inneboende i endodermal funktion och kan därför vara indirekt kopplad till felaktigt GATA-6-uttryck. Det vill säga att ett underskott av bronkiolförgrening kanske inte är ett resultat av direkt transkriptionsfel i GATA-6, utan snarare en bieffekt av ett sådant fel.

Se även

GATA -transkriptionsfaktor

Referenser

Vidare läsning

Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki E, Evans T, Lowry J, Truong L, Bell DW, Testa JR, Walsh K (1997). "Den mänskliga GATA-6-genen: struktur, kromosomal lokalisering och reglering av uttryck med vävnadsspecifika och mitogenresponsiva signaler". Genomik . 38 (3): 283–90. doi : 10.1006/geno.1996.0630 . PMID 8975704 .
Huggon IC, Davies A, Gove C, Moscoso G, Moniz C, Foss Y, Farzaneh F, Towner P (1997). "Molekylär kloning av humant GATA-6 DNA-bindande protein: höga uttrycksnivåer i hjärta och tarm". Biochim. Biofys. Acta . 1353 (2): 98–102. doi : 10.1016/s0167-4781 (97) 00049-3 . PMID 9294001 .
Yoshida T, Sato R, Mahmood S, Kawasaki S, Futai M, Maeda M (1997). "GATA-6 DNA-bindande protein uttryckt i humana gastriska adenokarcinom MKN45-celler" . FEBS Lett . 414 (2): 333–7. doi : 10.1016/S0014-5793 (97) 01017-X . PMID 9315713 . S2CID 31858845 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstruktion och karaktärisering av ett fullständigt längdberikat och ett 5'-ändberikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Wada H, Hasegawa K, Morimoto T, Kakita T, Yanazume T, Sasayama S (2000). "Ett p300-protein som en koaktiverare av GATA-6 vid transkription av genen för tung kedja av glatt muskel-myosin" . J. Biol. Chem . 275 (33): 25330–5. doi : 10.1074/jbc.M000828200 . PMID 10851229 .
Crawford SE, Qi C, Misra P, Stellmach V, Rao MS, Engel JD, Zhu Y, Reddy JK (2002). "Defekter i hjärtat, ögat och megakaryocyter i peroxisomproliferatoraktivatorreceptorbindande protein (PBP) nullembryon implicerar GATA-familjen av transkriptionsfaktorer" . J. Biol. Chem . 277 (5): 3585–92. doi : 10.1074/jbc.M107995200 . PMID 11724781 .
Liu C, Glasser SW, Wan H, Whitsett JA (2002). "GATA-6 och sköldkörtelns transkriptionsfaktor-1 interagerar och reglerar direkt uttryck av ytaktivt protein-C-gen" . J. Biol. Chem . 277 (6): 4519–25. doi : 10.1074/jbc.M107585200 . PMID 11733512 .
Kiiveri S, Liu J, Westerholm-Ormio M, Narita N, Wilson DB, Voutilainen R, Heikinheimo M (2003). "Transkriptionsfaktorer GATA-4 och GATA-6 under mus och mänsklig adrenokortikal utveckling". Endokr. Res . 28 (4): 647–50. doi : 10.1081/ERC-120016980 . PMID 12530677 . S2CID 22011163 .
Chang DF, Belaguli NS, Iyer D, Roberts WB, Wu SP, Dong XR, Marx JG, Moore MS, Beckerle MC, Majesky MW, Schwartz RJ (2003). "Cysteinrika LIM-bara proteiner CRP1 och CRP2 är kraftfulla differentieringskofaktorer för glatta muskler" . Dev. Cell . 4 (1): 107–18. doi : 10.1016/S1534-5807 (02) 00396-9 . PMID 12530967 .
Nemer G, Nemer M (2003). "Transkriptionell aktivering av BMP-4 och reglering av däggdjursorganogenes med GATA-4 och -6" . Dev. Biol . 254 (1): 131–48. doi : 10.1016/S0012-1606 (02) 00026-X . PMID 12606287 .
Abe M, Hasegawa K, Wada H, Morimoto T, Yanazume T, Kawamura T, Hirai M, Furukawa Y, Kita T (2003). "GATA-6 är involverad i PPARgamma-medierad aktivering av differentierad fenotyp i humana vaskulära glatta muskelceller" . Arterioscler. Tromb. Kärl. Biol . 23 (3): 404–10. doi : 10.1161/01.ATV.0000059405.51042.A0 . PMID 12615657 .
Ketola I, Toppari J, Vaskivuo T, Herva R, Tapanainen JS, Heikinheimo M (2003). "Transkriptionsfaktor GATA-6, cellproliferation, apoptos och apoptosrelaterade proteiner Bcl-2 och Bax i humana fostertestis" . J. Clin. Endokrinol. Metab . 88 (4): 1858–65. doi : 10.1210/jc.2002-021647 . PMID 12679484 .
Siltanen S, Heikkilä P, Bielinska M, Wilson DB, Heikinheimo M (2004). "Transkriptionsfaktor GATA-6 uttrycks i malign endoderm hos pediatriska äggula-tumörer och i teratom" . Pediatr. Res . 54 (4): 542–6. doi : 10.1203/01.PDR.0000081295.56529.E9 . PMID 12867597 .
Liu C, Ikegami M, Stahlman MT, Dey CR, Whitsett JA (2003). "Hämning av alveolarisering och förändrad lungmekanik hos möss som uttrycker GATA-6". Am. J. Physiol. Lungcell Mol. Physiol . 285 (6): L1246–54. doi : 10.1152/ajplung.00443.2002 . PMID 12909592 .
Benchabane H, Wrana JL (2003). "GATA- och Smad1-beroende förstärkare i Smad7-genet tolkar differentiellt benmorfogenetiska proteinkoncentrationer" . Mol. Cell. Biol . 23 (18): 6646–61. doi : 10.1128/MCB.23.18.6646-6661.2003 . PMC 193708 . PMID 12944489 .
Jimenez P, Saner K, Mayhew B, Rainey WE (2003). "GATA-6 uttrycks i människans binjurar och reglerar transkription av gener som krävs för adrenal androgenbiosyntes" . Endokrinologi . 144 (10): 4285–8. doi : 10.1210/en.2003-0472 . PMID 12959982 .
Saner KJ, Suzuki T, Sasano H, Pizzey J, Ho C, Strauss JF, Carr BR, Rainey WE (2005). "Steroid sulfotransferas 2A1-gentranskription regleras av steroidogen faktor 1 och GATA-6 i det mänskliga binjuret" . Mol. Endokrinol . 19 (1): 184–97. doi : 10.1210/me.2003-0332 . PMID 15388788 .
Kiiveri S, Liu J, Heikkilä P, Arola J, Lehtonen E, Voutilainen R, Heikinheimo M (2005). "Transkriptionsfaktorer GATA-4 och GATA-6 i humana adrenokortiska tumörer". Endokr. Res . 30 (4): 919–23. doi : 10.1081/ERC-200044149 . PMID 15666845 . S2CID 27526305 .

externa länkar

GATA6+protein,+människa vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)

Languages

In other projects