Den 1959 NCAA University Division Basketball Tournament involverade 23 skolor som leker i en enda eliminering spel för att bestämma nationella mästare för män NCAA Division I college basket i USA . Det började den 7 mars 1959 och slutade med mästerskapsmatchen den 21 mars i Louisville, Kentucky . Totalt 27 spel spelades, inklusive ett tredjeplatsspel i varje region och ett nationellt tredjeplatsspel.
För andra året i rad var Freedom Hall i Louisville värd för Final Four. Turneringen såg två nya platser, båda användes i första omgången. Staden Portland var värd för turneringen för första gången och var värd för Pacific International Livestock Exposition. Det skulle vara den enda gången byggnaden skulle vara värd, eftersom Memorial Coliseum skulle öppna nästa år. Delstaten New Mexico var värd för turneringen för första gången, där New Mexico A&M spelade spel på sin hemarena vid den tiden, Las Cruces High School Arena. Detta skulle vara tredje gången på tre år som en gymnasium var värd för turneringen och sista gången det skulle hända. Nästa gång Aggies skulle vara värd för turneringen skulle vara på sin egen arena på campus, Pan American Center . Alla andra arenor och alla nio värdstäder skulle vara värd för turneringsspel igen i framtiden.
Mississippi State kvalificerade sig för turneringen men universitetspresident Benjamin F. Hilbun stödde den sociala nedbrytningen av afroamerikanska medborgare och tillät inte laget att delta i turneringen där de möter afroamerikanska spelare.