Mycobacterium africanum -Mycobacterium africanum

Mycobacterium africanum
Vetenskaplig klassificering
Domän:
Provins:
Klass:
Beställa:
Familj:
Släkte:
Arter:
M. africanum
Binomialt namn
Mycobacterium africanum
Castets et al. 1969, ATCC 25420

Mycobacterium africanum är en art av Mycobacterium som oftast förekommer i västafrikanska länder, där det beräknas orsaka upp till 40% av lungtuberkulos. Symptomen på infektion liknar M. tuberkulos .

Det är medlem i Mycobacterium tuberculosis -komplexet .

Taxonomi

Det finns sju stora släktlinjer i Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC), med släktlinjer 5 och 6 klassificerade som Mycobacterium africanum . MTBC härstamning 5 är M. africanum typ 1, västafrikansk 1 (MAF1) och klassificeras baserat på en karakteristisk radering av Region of Differentiation (RD) 711. MAF1 finns vanligtvis runt Guineabukten. MTBC härstamning 6 är också känd som M. africanum typ 1, West African 2 (MAF2), och är klassificerad baserat på en radering av RD702. MAF2 förekommer i västra Afrika. M. africanum typ 2, östafrikansk, erkändes tidigare som en stam av Mycobacterium africanum ; det omklassificerades nyligen som Mycobacterium tuberculosis genotyp “Uganda” i en delbild av MTBC -släktlinje 4.

Historia

M. africanum beskrevs först som en underart inom MTBC, med fenotypiska egenskaper mellan M. tuberculosis och M. bovis , baserat på biokemisk testning av Castets 1968. Tidig genetisk analys visade att den skilde sig från M. tuberculosis pga. genomisk RD9 -deletion och distinkt GyrB -nukleotidsekvens , och skiljer sig från M. bovis på grund av en intakt RD12 och RD4.

Mikrobiologi

M. africanum odlas i pyruvatinnehållande medier under låga syreförhållanden och bildar karakteristiska "dysgoniska" kolonier. Till skillnad från M. tuberculosis , M. africanum shows katalasaktivitet, är nitrat negativ, och är mottaglig för tiofen-2-karboxylsyra-hydrazid (TCH) och pyrazinamid (PZA). M. africanum växer också långsammare än M. tuberculosis , vanligtvis tar det 10 veckor att utveckla kolonier snarare än 3 till 4 för M. tuberculosis .

Epidemiologi

M. africanum finns vanligast i västafrikanska länder. Det är endast en infektion hos människor och sprids via en luftburet väg från personer med öppna sjukdomsfall.

Det är inte helt förstått varför distributionen av M. africanum är begränsad till Västafrika, med endast sporadiska fall i andra regioner. Filogenetiska bevis visar att M. africanum förgrenade sig i ett tidigt skede från moderna Mtb -linjer i Amerika, Europa och Asien. Viss forskning tyder på att M. africanum är anpassat till västafrikanska befolkningar. M. africanum kan tävlas av andra Mtb -linjer i andra regioner; genetiska studier har emellertid inte funnit någon skillnad i antalet virulensgener eller genetisk mångfald mellan M. tuberculosis och M. africanum . Ingen djurreservoar har identifierats för Mycobacterium africanum trots att man har hittat olika vilda djur.

Den har en liknande grad av smittsamhet som den vanliga M. tuberculosis -organismen men är mindre benägna att utvecklas till klinisk sjukdom hos en immunkompetent individ. Det är dock mer troligt att M. africanum utvecklas från infektion till att orsaka sjukdom hos en HIV -positiv patient. I länder där M. africanum är endemiskt representerar det en viktig opportunistisk infektion i de senare stadierna av HIV -sjukdom.

Patogenes

Det är inte helt förstått hur de genetiska skillnaderna mellan M. africanum och M. tuberculosis ger upphov till den lägre patogeniciteten hos den förra. Det är emellertid känt att Region of Difference 9 (RD9) saknas hos M. africanum men förekommer i M. tuberculosis .

M. africanum har också anmärkningsvärda skillnader i lipidkatabolism och metabolism. Dessutom störs virulensvägar som dosR/Rv0081-regulon eller ESAT-6-reglering i M. africanum .

Behandling

På grund av liknande symptom och olika tillväxtförhållanden mellan Mycobacterium tuberculosis och africanum är odlingsmetoder opålitliga för diagnos. Molekylärbiologisk baserad genotypning har förbättrat identifieringen. I synnerhet "spoligotyping" eller "spacer oligonucleotide typing" är en snabb polymeraskedjereaktionsbaserad metod för genotypning av stammar i MTBC. Nyligen har snabba tester för sidoflöde utvecklats baserat på mpt64 -antigenet som finns i alla medlemmar av MTBC.

M. africanum har en lägre progressionstakt från latens till aktiv sjukdom än M. tuberculosis . M. africanum tuberculosis behandlas med en identisk regim som tuberkulos orsakad av M. tuberculosis . Den totala botningen är liknande, men eftersom fler M. africanum- patienter sannolikt är HIV-positiva kan de ha högre dödlighet av andra hiv-relaterade sjukdomar.

Typ stam

ATCC 25420 = CIP 105147

Referenser

Bibliografi

externa länkar